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真菌とは人に感染することのある植物の1種です。酵母やカビ、キノコ類はみな真菌です。

真菌の中には、ごく小さな胞子をまき散らして繁殖するものがあります。これらの胞子は空気中に浮いていることが多く、吸いこまれたり体の表面に付着するため、真菌感染症の多くは肺や皮膚から始まります。無数にある胞子のうち、皮膚に付着したり、肺に吸いこまれたりして人に感染を起こすものは、ごく一部にすぎません。皮膚表面の状態にもよりますが、人から人にうつる真菌感染症はほとんどありません。

カンジダなど、真菌の中には、体の表面や腸内に普通に存在しているものもあります。普段は無害ですが、皮膚や爪(真菌による皮膚感染症: はじめにを参照)、腟（ちつ）(腟の感染症を参照)、口(唇と舌の病気: 不快感を参照、歯周病: 感染による歯肉炎)、副鼻腔(真菌による副鼻腔感染を参照)に局所的な感染症を起こすことがあります。ただし、免疫機能が低下している人や、体内に静脈カテーテルなどの異物を入れている場合以外は、重症になることはほとんどありません。

ときに、真菌をチェックし抑えている正常なバランスが崩れることで感染が生じます。たとえば、消化管や腟に普通にみられる細菌は、ある種の真菌が増殖するのを抑えています。ところが、抗生物質を使用すると、こうした有益な細菌まで死んでしまい、逆に真菌が増えることになります。真菌が増えすぎると何らかの症状を引き起こすことがありますが、一般に軽症です。細菌が元通りに増えると、バランスが取り戻されて症状もなくなります。

ヒストプラスマ症、ブラストミセス症、コクシジオイデス症などの真菌感染症は、健康な人にも重い症状を起こします。

特定の地域によくみられる真菌感染症もあります。たとえば、米国ではコクシジオイデス症はほとんど南西部に限って発生するのに対して、ヒストプラスマ症はオハイオ川からミシシッピ川沿いの地域に起こります。ブラストミセス症は米国東部と中央部、そしてアフリカで特によくみられます。

真菌感染症の多くはゆっくり進行するので、受診するまでに何カ月も、場合によっては何年もたっていることがあります。免疫機能が低下している人（臓器移植を受けた人、免疫抑制薬による癌［がん］治療を受けている人、エイズ患者など）では、真菌感染症は急激に進行し、他の臓器へも急速に広がって死に至ることも少なくありません。

真菌感染症に有効な薬剤はいくつかありますが、真菌はその構造と化学組成から、容易には殺すことができません。抗真菌薬は、感染症が起きている皮膚、腟、口内などに直接塗ります。重い感染症には、経口または注射で投与することもあります。治療にはしばしば数カ月を要します。

真菌感染症を起こす危険因子 免疫機能を抑制する薬剤の使用 抗癌剤（化学療法薬） コルチコステロイド薬や他の免疫抑制薬 病気や患者の状況 エイズ 腎不全 糖尿病 気胸など肺の疾患 ホジキン病や他のリンパ腫 白血病 広範囲のやけど 臓器移植

重症真菌感染症の主な治療薬 薬剤名 主な適応 副作用 アムホテリシンB さまざまな真菌感染症 悪寒、発熱、頭痛、嘔吐、低カリウム血症、腎障害、貧血 カスポファンジン アスペルギルス、カンジダにも使用可 発熱、吐き気、血管の炎症 フルコナゾール カンジダやそのほかクリプトコッカスなどの真菌感染症 肝毒性があるが、ケトコナゾールより軽度 フルシトシン カンジダおよびクリプトコッカス感染症 骨髄と腎臓の障害 イトラコナゾール カンジダおよびその他の真菌感染症 吐き気、下痢、ケトコナゾールより軽度の肝毒性 ケトコナゾール カンジダおよびその他の真菌感染症 吐き気と嘔吐、テストステロンとコルチゾールの産生阻害、肝毒性 ボリコナゾール アスペルギルス、カンジダ 視力障害